Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTMR11A4FU01 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR11A4FU01 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms