Protein–RNA interactions for Protein: A4D0T7

SMIM30, Small integral membrane protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM30A4D0T7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMIM30A4D0T7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM30A4D0T7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms