Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMD3A2A2Y4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms