Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC61Q9Y6R9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms