Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LYVE1Q9Y5Y7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LYVE1Q9Y5Y7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LYVE1Q9Y5Y7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LYVE1Q9Y5Y7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LYVE1Q9Y5Y7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LYVE1Q9Y5Y7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LYVE1Q9Y5Y7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LYVE1Q9Y5Y7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LYVE1Q9Y5Y7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LYVE1Q9Y5Y7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LYVE1Q9Y5Y7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LYVE1Q9Y5Y7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LYVE1Q9Y5Y7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LYVE1Q9Y5Y7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LYVE1Q9Y5Y7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms