Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
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SNX13Q9Y5W8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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SNX13Q9Y5W8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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SNX13Q9Y5W8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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SNX13Q9Y5W8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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SNX13Q9Y5W8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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SNX13Q9Y5W8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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SNX13Q9Y5W8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX13Q9Y5W8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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