Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF3C3Q9Y5Q9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF3C3Q9Y5Q9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms