Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B0

CTDP1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1Q9Y5B0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTDP1Q9Y5B0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms