Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms