Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A5

TRRAP, Transformation/transcription domain-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRRAPQ9Y4A5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms