Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LEMD3Q9Y2U8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LEMD3Q9Y2U8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LEMD3Q9Y2U8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LEMD3Q9Y2U8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LEMD3Q9Y2U8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LEMD3Q9Y2U8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LEMD3Q9Y2U8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LEMD3Q9Y2U8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LEMD3Q9Y2U8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LEMD3Q9Y2U8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LEMD3Q9Y2U8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LEMD3Q9Y2U8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LEMD3Q9Y2U8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LEMD3Q9Y2U8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LEMD3Q9Y2U8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LEMD3Q9Y2U8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LEMD3Q9Y2U8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LEMD3Q9Y2U8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LEMD3Q9Y2U8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LEMD3Q9Y2U8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LEMD3Q9Y2U8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LEMD3Q9Y2U8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LEMD3Q9Y2U8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LEMD3Q9Y2U8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LEMD3Q9Y2U8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LEMD3Q9Y2U8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LEMD3Q9Y2U8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LEMD3Q9Y2U8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LEMD3Q9Y2U8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms