Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP20Q9Y2K6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms