Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNEQ9Y223 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNEQ9Y223 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms