Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVW-1Q9UQF0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ERVW-1Q9UQF0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms