Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SAMD4AQ9UPU9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAMD4AQ9UPU9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms