Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AGAP1Q9UPQ3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AGAP1Q9UPQ3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms