Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms