Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BRPF3Q9ULD4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRPF3Q9ULD4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRPF3Q9ULD4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRPF3Q9ULD4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRPF3Q9ULD4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRPF3Q9ULD4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRPF3Q9ULD4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRPF3Q9ULD4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRPF3Q9ULD4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRPF3Q9ULD4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms