Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP21Q9UK80 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP21Q9UK80 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms