Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RIMS3Q9UJD0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms