Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN11AQ9UI33 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms