Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GPN3Q9UHW5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms