Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CHORDC1Q9UHD1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHORDC1Q9UHD1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms