Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms