Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALCOCO1Q9P1Z2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CALCOCO1Q9P1Z2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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