Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCHIP1Q9P0W5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms