Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
DLL3Q9NYJ7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms