Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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