Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FBXO28Q9NVF7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms