Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LTBP3Q9NS15 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBP3Q9NS15 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
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