Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms