Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRDM8Q9NQV8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRDM8Q9NQV8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRDM8Q9NQV8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRDM8Q9NQV8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRDM8Q9NQV8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRDM8Q9NQV8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRDM8Q9NQV8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRDM8Q9NQV8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PRDM8Q9NQV8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRDM8Q9NQV8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRDM8Q9NQV8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRDM8Q9NQV8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRDM8Q9NQV8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRDM8Q9NQV8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRDM8Q9NQV8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRDM8Q9NQV8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRDM8Q9NQV8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRDM8Q9NQV8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRDM8Q9NQV8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRDM8Q9NQV8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRDM8Q9NQV8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRDM8Q9NQV8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRDM8Q9NQV8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRDM8Q9NQV8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRDM8Q9NQV8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRDM8Q9NQV8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRDM8Q9NQV8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRDM8Q9NQV8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms