Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRMS1Q9HCU9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRMS1Q9HCU9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms