Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCF6

TRPM3, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM3Q9HCF6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TRPM3Q9HCF6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRPM3Q9HCF6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRPM3Q9HCF6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRPM3Q9HCF6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRPM3Q9HCF6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRPM3Q9HCF6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRPM3Q9HCF6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TRPM3Q9HCF6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TRPM3Q9HCF6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TRPM3Q9HCF6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRPM3Q9HCF6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TRPM3Q9HCF6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRPM3Q9HCF6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRPM3Q9HCF6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRPM3Q9HCF6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRPM3Q9HCF6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRPM3Q9HCF6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TRPM3Q9HCF6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRPM3Q9HCF6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRPM3Q9HCF6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRPM3Q9HCF6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRPM3Q9HCF6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRPM3Q9HCF6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRPM3Q9HCF6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRPM3Q9HCF6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRPM3Q9HCF6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms