Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CENPJQ9HC77 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CENPJQ9HC77 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CENPJQ9HC77 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms