Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLSPNQ9HAW4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms