Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM12Q9H4Q4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM12Q9H4Q4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms