Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNMDQ9H2S6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNMDQ9H2S6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms