Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Q0

FAM49A, Protein FAM49A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49AQ9H0Q0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM49AQ9H0Q0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM49AQ9H0Q0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM49AQ9H0Q0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM49AQ9H0Q0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM49AQ9H0Q0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM49AQ9H0Q0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM49AQ9H0Q0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM49AQ9H0Q0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms