Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF541Q9H0D2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF541Q9H0D2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF541Q9H0D2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF541Q9H0D2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF541Q9H0D2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF541Q9H0D2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF541Q9H0D2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF541Q9H0D2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF541Q9H0D2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF541Q9H0D2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF541Q9H0D2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF541Q9H0D2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF541Q9H0D2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF541Q9H0D2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF541Q9H0D2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF541Q9H0D2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF541Q9H0D2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF541Q9H0D2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF541Q9H0D2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF541Q9H0D2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF541Q9H0D2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF541Q9H0D2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF541Q9H0D2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF541Q9H0D2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF541Q9H0D2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF541Q9H0D2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF541Q9H0D2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF541Q9H0D2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF541Q9H0D2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF541Q9H0D2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF541Q9H0D2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF541Q9H0D2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF541Q9H0D2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF541Q9H0D2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF541Q9H0D2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF541Q9H0D2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms