Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GFRA4Q9GZZ7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GFRA4Q9GZZ7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms