Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZCCHC2Q9C0B9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZCCHC2Q9C0B9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZCCHC2Q9C0B9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZCCHC2Q9C0B9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZCCHC2Q9C0B9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZCCHC2Q9C0B9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZCCHC2Q9C0B9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZCCHC2Q9C0B9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZCCHC2Q9C0B9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms