Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NMES1Q9C002 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NMES1Q9C002 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms