Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM55Q9BYV6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms