Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDCA4Q9BXL8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDCA4Q9BXL8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms