Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VN1R3Q9BXE9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms