Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWU1

CDK19, Cyclin-dependent kinase 19, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK19Q9BWU1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CDK19Q9BWU1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms