Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH2

FUNDC2, FUN14 domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUNDC2Q9BWH2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FUNDC2Q9BWH2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms