Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms