Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB2BQ9BVA1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms